Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNDQ07001 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNDQ07001 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms