Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms