Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APBA1Q02410 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APBA1Q02410 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms