Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms