Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPL23P62829 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPL23P62829 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPL23P62829 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms