Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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