Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms