Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms