Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC5A3P53794 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms