Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms