Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms