Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CDKN1BP46527 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms