Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms