Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms