Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms