Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKBRP32239 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKBRP32239 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms