Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ARID4AP29374 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ARID4AP29374 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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