Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms