Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms