Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO2P25791 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO2P25791 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms