Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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