Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms