Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms