Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CXCL3P19876 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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