Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms