Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CREB1P16220 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CREB1P16220 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB1P16220 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms