Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNT1P13805 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms