Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODC1P11926 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms