Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms