Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RARBP10826 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RARBP10826 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RARBP10826 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RARBP10826 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RARBP10826 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RARBP10826 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RARBP10826 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RARBP10826 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RARBP10826 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms