Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms