Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms