Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFB1P01137 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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