Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TOXO94900 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms