Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms