Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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