Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PLXNB1O43157 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms