Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN2O15020 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms