Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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