Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F3O00716 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F3O00716 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms