Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms