Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms