Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NCN8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NCN8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NCN8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NCN8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NCN8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A6NCN8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms