Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms