Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL20Q9Y2M5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms