Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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