Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIMS3Q9UJD0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms