Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms