Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGXB4Q9UGU5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms