Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRODH2Q9UF12 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms